1.連接料的種類(lèi)，溶劑型油墨用連接料的選擇面比較寬，水性油墨常見(jiàn)的樹(shù)脂體系基本都可以作為溶劑型連接料，比如聚氨酯、聚酰胺、硝化棉、丙烯酸等；而水性體系目前商業(yè)化的連接料產(chǎn)品僅僅局限于丙烯酸樹(shù)脂以及少量的聚氨酯。這就從根本上決定了水性油墨使用樹(shù)脂時(shí)在性能上沒(méi)有那么大的可調(diào)節(jié)余地，只能依靠丙烯酸樹(shù)脂本身的性能進(jìn)行調(diào)整。
2.水性油墨體系是一個(gè)分散體，不是均一連續(xù)的體系，這是水性油墨在儲(chǔ)存穩(wěn)定性方面和溶劑型油墨存在差別的一個(gè)主要原因。
同時(shí)成膜的機(jī)理也會(huì)有差別，溶劑型油墨在溶劑揮發(fā)后會(huì)立即形成一個(gè)相對(duì)均一和致密的油墨層；而水性油墨在水揮發(fā)后，需要一定的時(shí)間讓各個(gè)分散體相互靠近、相互作用后才能成膜，成膜需要一定的時(shí)間，這也是水性油墨在塑料承印物上即時(shí)牢度（又稱(chēng)為下機(jī)油墨牢度）不好的一個(gè)重要原因。
3.水性油墨體系需要在堿性條件下才能保持穩(wěn)定，這就要添加不同種類(lèi)的胺來(lái)調(diào)節(jié)體系的pH值。
4.水作為一種稀釋劑，與溶劑型油墨使用的有機(jī)溶劑相比，水的比熱容大，沸點(diǎn)高，揮發(fā)速度慢；在印刷的時(shí)候，同等干燥條件下，印刷速度沒(méi)有溶劑型油墨快，而印刷速度慢，導(dǎo)致產(chǎn)能受到影響，直接影響印刷廠的經(jīng)濟(jì)效益。這是很多印刷廠不愿意轉(zhuǎn)為使用水性油墨的一個(gè)重要原因。